Le neuf fois champion suisse de lancer du poids et trois fois champion de lancer du disque est décédé après une longue maladie, un jour avant son 82ème anniversaire. Egger souffrait d'insuffisance respiratoire due à une insuffisance cardiaque. « Il y a trois ans, on lui a implanté un stimulateur cardiaque », se souvient son proche ami Edy Hubacher, champion olympique de bobsleigh 1972. « Je l'ai encore motivé à attendre son anniversaire pour mourir. Mais il m'a dit qu'il souhaitait partir avant. »
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Egger a reçu, à sa demande, une aide palliative. Quelques jours avant sa mort, Egger a reçu la visite de Nadja et Werner Günthör : « Malheureusement, il ne nous a plus reconnus. Jean-Pierre restera toujours dans nos cœurs. » Egger, participant aux Jeux olympiques en 1976 et 1980, est encore classé en 2e position de la liste des meilleurs suisses éternels derrière Günthör.
Son palmarès est impressionnant : à trois reprises, il a entraîné Werner Günthör pour le titre de champion du monde du lancer du poids et a grandement contribué à la carrière de la lanceuse de poids néo-zélandaise à succès Valerie Adams. De plus, le Neuchâtelois bilingue a joué un rôle déterminant dans les succès du sauteur à ski Simon Ammann et du roi de la lutte suisse Matthias Sempach. Des équipes comme les vainqueurs suisses de la Coupe de l'America Alinghi, les équipes de football des Grasshoppers de Zurich ou l'Olympique de Marseille en France et l'équipe nationale de basket-ball française ont également profité de son expertise.
Que ce soit en tant qu'entraîneur, formateur, coach, motivateur, pédagogue, conférencier ou auteur, Egger a développé dans de nombreuses fonctions des plans d'entraînement, des instruments et des stratégies qui ont aidé ou aident encore une multitude d'athlètes, d'équipes et d'entreprises à réaliser leurs rêves.
Il décrivait ainsi sa recette du succès : « J'aime les personnes avec lesquelles je travaille. Je suis très, très proche de leurs rêves. Probablement parce que j'ai eu les mêmes rêves. »